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Le kiwi est le fruit de bouleversements génomiques

mardi 29 octobre 2013

par Agnès Vernet

La publication du premier génome complet d’Actinidia chinensis, une variété commune de kiwi, révèle une histoire génétique tourmentée.

Originaire d’Asie du Sud-Ouest, le kiwi est resté un fruit méconnu jusqu’à ce que les fermiers néozélandais s’emparent des semences et les domestiquent au début du XXe siècle. Très recherché pour ses qualités gustatives et nutritionnelles, il est aujourd’hui au centre d’enjeux économiques importants : en 2011, sa production mondiale s’élevait à 1,44 million de tonnes, d’après l’Organisation des Nations Unies pour l’alimentation et l’agriculture. Mais jusqu’à présent, aucune espèce du genre Actinidia n’avait été séquencée complètement. Un consortium chinois et américain publie, pour la première fois, le génome entier d’A. chinensis, une espèce de kiwi très répandue en Chine.
L’étude de ces 39 040 gènes révèle qu’après la duplication de son génome menant à l’hexaploïdie – un événement partagé par tous les dicotylédones –, ce kiwi a subi deux autres duplications complètes plus récentes, après la divergence d’avec les tomates et les pommes de terre. Cette importante expansion génomique d’A. chinensis semble avoir conduit à une néofonctionnalisation à l’origine du métabolisme caractéristique du kiwi, lequel porte de nombreux gènes nécessaires à la production de vitamine C, de flavonoïdes et de caroténoïdes.
Première séquence complète du genre Actinidia, ce génome n’est que le troisième publié au sein des astérides après celui de la pomme de terre et de la tomate. Cette ressource génomique – disponible en ligne –, devrait largement participer aux futures analyses comparatives et évolutionnaires de cette lignée.

Huang S et al. (2013) Nat Commun 4, 2640

A. chinensis
© Genet at German Wikipedia (CC-BY-SA-3.0 ou CC-BY-SA-3.0-de) via Wikimedia Commons

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